临床诊断是指医生给病人检查疾病，并对病人疾病的病因、发病机制作出分类鉴别，以此作为制定治疗方案的方法和途径。按照临床诊断的标准确诊的病例为临床诊断病例。而具备病原学证据的疑似病例为确诊病例。
临床诊断的首要步骤就是通过询问就诊者的主观感受症状来采集病史资料。病史对诊断可起到定向作用，能提示诊断的线索。
2020年2月13日，湖北省卫健委发布的新冠肺炎疫情情况通报中提到，根据《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案（试行第五版）》，近期湖北省对既往的疑似病例开展了排查并对诊断结果进行了订正，对新就诊患者按照新的诊断分类进行诊断。
湖北以外其他省份仍然分为疑似病例和确诊病例两类， 湖北省增加临床诊断分类 。并且，湖北省 疑似病例标准放宽 ：无论有没有流行病学史，只要符合发热和/或呼吸道症状和发病早期白细胞总数正常或降低，或淋巴细胞计数减少这2条临床表现，便可考虑为疑似病例。而疑似病例具有肺炎影像学特征者，为临床诊断病例。确诊病例诊断标准没变。
这意味着，疑似病例只要拍CT，有新冠肺炎肺部病变的特征，在没有核酸检测的情况下，就成为临床诊断病例。
中央指导组专家、北京朝阳医院副院长童朝晖说：我们在看病诊断肺炎时，能够拿得到的病原学，也就百分之二三十，剩下的百分之七八十要靠临床诊断。从临床思维和临床医生的临床路径角度来说，增加临床病例的诊断，有益于临床医生对疾病多一个判断。
前一段时间我们主要是靠核酸来进行确诊病例。实际上按照我们临床诊断的标准，是有一大部分疑似病例的。
在临床工作中，我们从这几个方面综合诊断：第一，如果病人在湖北或者在武汉地区，那肯定是已经有流行病学史了；第二是发热、呼吸道咳嗽、憋气的症状，这是临床症状；第三是临床有体征，查体检查；第四个是CT影像。比如说我们常见的肺炎链球菌肺炎，实际上能拿到阳性的比例以及培养的比例也就百分之二三十，大部分是靠临床医生来对临床病例下一个临床诊断。
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