将荧光笔的笔头蘸点酒精，或者向笔管内的海绵里倒一点白酒即可使用。也可以先擦掉荧光笔已经变干的粉末，将笔头放在清水里洗一下，等笔头上的清水完全消失后，即可正常使用。
荧光笔分为水性和油性，水性荧光笔无毒，做记号时候的笔触也比较粗，颜色鲜艳但透明度也比较高，被荧光笔覆盖的文字依然清晰可见，非常适合做记号。
荧光笔中有荧光剂作为发光物质，属于有毒物质，小孩子弄到手上可能会误入到眼睛、鼻子、嘴巴等敏感部位，对人体有害，所以中小学生尽量不用荧光笔做记号。
使用完的荧光笔一定要把笔帽扣上，除了防止荧光笔水分散失之外，还防止荧光笔不小心划到衣服上、书本上等地方造成不必要的清洗，且荧光笔的清洗并不容易。