生蚝肚子中的黑色部分不要吃。生蚝肚子中的黑色部分是生蚝的代谢物和部分泥沙，如果生蚝所生存的环境有大量的重金属物质，那么黑色部分也会有一些重金属元素，因此，这个部位是不可以吃的。
生蚝大多数生活在沿海地区，会黏附在礁石上，随着海浪的冲刷，这种食物本身就会吸附一些泥沙，所以，在吃生蚝的时候，看到的黑色部分，是生蚝的代谢物和泥沙。
生蚝的吃法有很多种，生吃是生蚝的一种很鲜美的吃法，只是这种吃法不算健康。生吃生蚝可以体会生蚝鲜美肉质，只是生吃的生蚝最好是生长在非常理想的并且无污染的环境下，这样的生蚝一般没有寄生虫还有重金属污染。
生蚝还可以烤着吃。准备好葱、姜、蒜等调味品，将配料在热锅中炒好，撒入适量的盐分，加入自己喜欢的配料，将调好的馅料装入生蚝的壳子中，提前将烤箱预热，将温度调至二百度左右，拷完以后取出来，这样就可以放心吃了。
生蚝还可以做成汤，准备好生蚝干泡发，将其洗干净，切片放入锅中，紫菜洗干净放入锅中，烧开之后，将玉米淀粉搅拌均匀，放入烧开的汤锅中，将打散的鸡蛋放入，最后放入适量的调味品即可。