1、成分不同。成分不同是翡翠、玉和玛瑙主要的区别之一，传统意义上的玉指软玉，主要矿物成分是透闪石。翡翠的主要矿物成分是硬玉，而玛瑙的主要矿物成分是石英。
2、硬度不同。此外翡翠、玉和玛瑙的硬度也有所区别，翡翠是硬度最大的玉石，莫氏硬度为6.5～7.5，玛瑙的硬度为6.5～7.0。传统玉石中以和田玉最具代表性，硬度为6.0～6.5。
3、比重不同。翡翠、玉和玛瑙的比重同样存在区别，翡翠的比重为3.25g～3.45克/立方厘米，玛瑙的比重为2.65克/立方厘米，而传统玉石中的和田玉比重为2.95～3.17克/立方厘米。