1、功效区别：黑玛瑙是长寿之石，具促进幸福及富足之效。黑曜石，属于吸纳性能量，极度辟邪，能强力化解负能量。
2、成分区别：黑曜石以二氧化硅为主，但不属于结晶类的宝石，玛瑙的主要成分也是二氧化硅，属于隐晶质结构，但一般是半透明或不透。
3、颜色区别：一般优质天然玛瑙有玻璃和油质光泽，天然图案色泽艳丽明快，自然纯正，光洁细润；纹理自然流畅，最主要的是玛瑙上有渐变色，其颜色分明，层次感强，条带明显。而品质一般的玛瑙的色彩和光泽均要差一些。黑玛瑙的纹理表现上没有明显的椭圆环形，只是少部分天然玛瑙中内有结晶状态,如条带状、斑点状、致密块状。