常温保存
蜂王浆在常温下的保质期仅仅只有3天，原因是蜂王浆对温度、光照、空气等非常敏感，例如在常温下新鲜蜂王浆易因微生物大量繁殖而变质，因此新鲜蜂王浆要趁尚未变质之前及时食用完，或者将短时间吃不完的蜂王浆放到冰箱中冷藏保存，另外长途运输新鲜蜂王浆时也要加冰袋来延长保质期。
混蜜保存
蜂王浆与蜂蜜混合后可保存1个月左右，原因是蜜蜂完全酿制成熟的蜂蜜富含抗菌成分，加之蜂蜜因浓度高而具有高渗透压的特性，从而使得天然成熟蜜几乎没有严格的保质期，因此可利用蜂蜜的这一特性来延长蜂王浆的保质期，具体做法是将蜂王浆和蜂蜜按1:3混合并密封保存在避光阴凉的地方。
低温保存
蜂王浆在低温环境下保存可延长保质期，例如5℃时蜂王浆可保存3个月，0℃时蜂王浆可保存半年，-5℃时蜂王浆可保存一年，而-18℃时蜂王浆可保存两年以上，因此蜂王浆规模化生产时都是冷冻保存，其中最为人们所熟知的是蜂王浆冻干粉，事实上蜂王浆冻干粉就是蜂王浆脱水冷冻后制成的。