玛雅文明的消失至今还没有一个明确的结论，科学家和考古学家对玛雅文明的消失提出了许多的假设，比如外族入侵人口增多、感染疾病、气候变化等。从玛雅文明的地理环境上来说，最可能的原因就是文明的过度发展而导致人口过多发生资源掠夺战争。
玛雅文明消失的原因
有一支考古队对玛雅文明的遗址进行了考察。后来他们认为玛雅人消失于战争中。因为玛雅人大量的修建金字塔用于祭祀，而祭祀的用品不仅有粮食，牲畜还包括人。在玛雅文明的遗址中，发现了密密麻麻用来祭祀的人头。因为祭祀活动的频繁，以及战争多发导致了整个部落的覆灭。
玛雅人生活的地区是地震频发的区域。即便是现在的墨西哥等地，也常常会有地震的发生，也会遭遇台风飓风的袭击。频繁的自然灾害可能会导致玛雅人不得不背井离乡。另外，即便玛雅人有着高度发达的文明，但是他们却很难免于瘟疫。一旦瘟疫发生，部落中的人就会大量的死去，而玛雅人也只好另辟家园。
根据玛雅的地形来判断，可能是因为文明的过度发展而导致人口密集，资源消耗量过大，再加上各种的灾难，生活在雨林中的玛雅人难以负担如此庞大的人口，就发生了资源掠夺的战争。许多玛雅人远走他乡，而玛雅文化因玛雅的知识和文化只掌握在少数的贵族手中，后来就逐渐消失。