在挑选的时候可以根据羊驼的品种来进行挑选，比较好的两个亚种就是华卡约以及苏利，华卡约比较常见，而苏利是长绒品种，在全球的比例不到10%。
在挑选的时候可以根据产地挑选，羊驼都是产自于南美洲的，并且新西南的羊驼产业起步是比较早的，所有首选该地区的羊驼。
根据羊驼的年龄也可以进行挑选，羊驼的断奶期是6个月，一般来说挑选购买羊驼都要选择1年以上的，发育比较完善了，抗应激能力也比较好。
此外就是根据性别来选择的，雄性要比雌性的抗应激能力抢，所以更容易成活，选择雌性的话后期的经济效益能够得到提升，自己配种的话，雌雄比例4：1。