自考毕业论文申请的时间各省份是不一样的，有的省份论文是与其他科目一样随时可以报名，有的省份是需要把理论课全部考完才可以报考论文。
你可以在自考报名时报考论文，如果可以报上论文，就说明可以申请论文，如果无法报上名，说明你所在的省份对论文的报考是有规定的，需要先把其他的理论课考完才可以报论文。自考论文答辩一年二次，分别是四月和十月。
自考论文的程序：
1、按照其他科目一样报名，有论文这个科目的，报名费用大约20元左右。
2、报好名后，自考办会联系你这个专业的主考院校，主考院校会通知你参加论文的培训（建议参加论文培训，一般论文是有不通过率的，如果你不参加培训，基本上是不能过关的）
3、按照主考院校的通知时间、费用等事项参加培训，并给你安排指导老师。
4、根据主考院校的论文写作时间表，按计划写论文，多与指导老师联系修改你的论文。论文的题目是自己想的，你的指导老师也会根据你的情况和要求，出一些论文题目让你选择。
5、按照论文的计划，打印成册上交给主考院校，参加答辩。
6、论文的报考是没有有效期的，这次没通过，就算结束了，要到下次重新报名。