1、种子选择和种子消毒。 种子应选用无病果实，以减少种子。 播种前，将种子用52℃~56℃温水浸泡25~30分钟，杀菌效果更佳。
2、注意地面、高沟、深沟的选择。高温高湿是炭疽病发生的有利条件，栽培苦瓜应选择地势较高的土壤。沟要高深，注意排水，适当密植，疏通老叶和病叶，以利于通风换气，改变田间小气候，降低田间湿度。此外，植物应适当施肥，以便它们能够茁壮成长并增加抗病能力。
3、药物控制。苦瓜在幼果期和高温多雨天气易发病。防止连续喷药，喷50%多菌灵500倍液500倍液一次，连用7～10天，或75%百菌清可湿性粉剂600倍液800倍液，或配1：15：150波尔多液防治。