1、性质不同
仰韶文化是一种母系氏族社会文化,所谓母系氏族社会是指女性在社会中亨有统治地位,并且掌握氏族领导权的社会文化。
河姆渡文化,是中国原始社会新石器时代的一种文化现象.因为第一次发现于浙江省余姚市河姆渡村,因而命名.距今约7000至6000年的历史。
2、遗址不同
仰韶文化的遗址一般在河流两岸经长期侵蚀而形成的阶地上,或在两河汇流处较高而平坦的地方,这些地方土地平坦肥沃,有利于农业、畜牧,取水和交通。
河姆渡文化主要分布于是长江流域下游地区,主要在杭州湾南岸的宁绍平原及舟山群岛。
3、农业不同
仰韶文化是以原始农业为基础、以食物生产为主、以食物采集为付的氏族社会文化,其生产工具以较发达的磨制石器为主,常见的有：刀、斧、锛、凿、箭头、纺织用的石纺轮等.其主要农作物为栗和黍，其主要饲养家畜是猪、狗和羊。
河姆渡文化在农业方面：以人工栽培的水稻为主,在遗址第4层较大范围内,普遍发现稻谷遗存,这对于研究中国水稻栽培的起源及其在世界稻作农业史上的地位,具有重大意义.河姆渡文化的农具,最具有代表性的是大量使用耒耜。