为什么债券的公允价值变动有的计入资本公积，有的计
看公司持有目的，是划归为“交易性金融资产”还是划归为“可供出售金融资产”。“交易性金融资产”的公允价值变动计入公允价值变动；“可供出售金融资产”的公允价值变动计入资本公积。前者短期内会出售，所以，相应公允价值变动计入公司损益；后者不一定在短期内出售，所以，公允价值变动只是影响利润表后的其它综合性收益。
不过，债券更常见的是持有至到期，作为“持有至到期投资”进行计量。
扩展阅读：公允价值变动损益与资本公积的区别：
1、定义不同：
公允价值变动损益是指企业以各种资产，如投资性房地产、债务重组、非货币交换、交易性金融资产等公允价值变动形成的应计入当期损益的利得或损失。
资本公积是指企业在经营过程中由于接受捐赠、股本溢价以及法定财产重估增值等原因所形成的公积金。
2、所属账户类别不同：
公允价值变动损益属于损益类账户；资本公积属于所有者权益类账户。
3、反映内容不同：
公允价值变动损益是公允价值与账面余额之间的差额。该项目反映了资产在持有期间因公允价值变动而产生的损益。也是新利润表上的项目"公允价值变动收益"填列依据。
资本公积是指投资者或者他人投入到企业、所有权归属于投资者、并且投入金额上超过法定资本部分的资本。
总之，公允价值变动损益与资本公积是两个不同的会计科目。
公允价值变动损益是指一项资产在取得之后的计量，即后续采用公允价值计量模式时，期末资产账面价值与其公允价值之间的差额。是新会计准则下一个全新项目，其对上市公司的净利润与应交所得税的影响需要根据持有期间与处置期间分别确定。
资本公积包括：：资本（股本）溢价、其他资本公积、资产评估增值、资本折算差额。
资本溢价是公司发行权益债券价格超出所有者权益的部分，股本溢价是公司发行股票的价格超出票面价格的部分。
其他资本公积包括可供出售的金融资产公允价值变动、长期股权投资权益法下被投资单位净利润以外的变动。
资产评估增值是按法定要求对企业资产进行重新估价时，重估价高于资产的账面净值的部分（参见资产评估）。
资本折算差额是外币资本因汇率变动产生的差额。
债券的公允价值变动会计分录
公允价值变动损益和投资收益都属于损益类账户，借方记减少，贷方记增加
比如如果金融资产升值
借：交易性金融资产——公允价值变动
贷：公允价值变动损益
公允价值变动损益在金融资产处置或减值时，必须转入投资收益
借：公允价值变动损益
贷：投资收益
其他债权投资期末公允价值变动包含期末计提的应收利息吗
权益法下，被投资方其他债权投资和其他权益工具投资的公允价值变动计入其他综合收益，投资方则计入其他综合收益。如果是被投资方损益变动，则投资方计入投资收益。
公允价值变动：由于市场因素如需求变化，商品自身价值的变化产生买卖双方对价格的重新评估的过程，前后两者之间的公允价值变动产生公允价值变动损益。在财务会计处理中：“公允价值变动”科目与“公允价值变动损益”科目相对应的。
其他债权投资的相关会计分录：
1、初始计量时的会计分录：
借：其他债权投资——成本（面值）
应收利息/其他债权投资——应计利息
贷：银行存款等
其他债权投资——利息调整（可借可贷）
2、后续计量时的会计分录：
借：应收利息/其他债权投资——应计利息（双面）
其他债权投资——利息调整（可借可贷）
贷：投资收益【期初摊余成本（账面余额）×实际利率】
①升值时的会计分录：
借：其他债权投资——公允价值变动
贷：其他综合收益——其他债权投资公允价值变动
其他综合收益，是指企业根据其他会计准则规定未在当期损益中确认的各项利得和损失。
②贬值（正常情况）时的会计分录：
借：其他综合收益——其他债权投资公允价值变动
贷：其他债权投资——公允价值变动
3、处置时的会计分录：
总原则：
①出售所得的价款与其账面价值的差额计入当期损益；
②将原来直接计入其他综合收益的公允价值变动的累计额转出，计入当期损益。
借：银行存款
贷：其他债权投资——成本
其他债权投资——利息调整（可借可贷）
其他债权投资——应计利息
其他债权投资——公允价值变动（可借可贷）
投资收益（可借可贷）
同时：
借：其他综合收益——其他债权投资公允价值变动
贷：投资收益
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如何记录其他债权投资公允价值变动？
公允价值变动:由于市场因素如需求变化，商品自身价值的变化产生买卖双方对价格的重新评估的过程;前后两者之间的公允价值变动产生公允价值变动损益.
其他债权投资的公允价值变动如何计算?
公允价值变动:由于市场因素如需求变化，商品自身价值的变化产生买卖双方对价格的重新评估的过程;前后两者之间的公允价值变动产生公允价值变动损益.
(一)、本科目核算企业在初始确认时划分为以公允价值计量且其变动计入当期损益的金融资产或金融负债(包括交易性金融资产或金融负债和直接指定为以公允价值计量且其变动计入当期损益的金融资产或金融负债)和以公允模式进行后续计量的投资性房地产.
(二)、本科目应当按照交易性金融资产、交易性金融负债等进行明细核算.
(三)、公允价值变动损益的主要账务处理
资产负债表日，企业应按交易性金融资产的公允价值高于其账面余额的差额，借记"交易性金融资产--公允价值变动"，"投资性房地产--公允价值变动"科目，贷记本科目;公允价值低于其账面余额的差额，做相反的会计分录.
出售交易性金融资产时，应按实际收到的金额，借记"银行存款"等科目，按其账面余额，贷记"交易性金融资产--成本、公允价值变动"科目，同时，按"公允价值变动损益"科目的余额，借记或贷记本科目，贷记或借记"投资收益"科目.处置以公允模式进行后续计量的投资性房地产时，按照收到的金额，借记"银行存款"等科目，贷记"投资性房地产--成本、公允价值变动"科目.同时，按"交易性金融资产--公允价值变动"科目的余额，借记或贷记本科目，贷记或借记"投资收益"科目.同时，按"公允价值变动损益"科目的余额，借记或贷记本科目，贷记或借记"投资收益"科目.
(四)、期末，应将本科目余额转入"本年利润"科目，结转后本科目无余额.
(五)、可供出售金融资产公允价值变动应计入"资本公积--其他资本公积"不在此科目核算.