1、两者的特点不同：
京东超市的特点：该超市采用RFID射频识别技术，实现被动式的商品统计，顾客只需穿过结算通道即可自动完成结算直接出店，整个购物过程完全在“无感知”的情况下完成。
京东自营的特点：在一定时间点之前提交的现货订单（以订单出库后完成拣货的时间点开始计算），京东自营将于次日送达。除211限时达服务外，京东次日达服务还覆盖全国248座城。
2、两者的创建时间不同：
京东超市的创建时间：2018年4月10日，京东在吉林省开设的首家京东X无人超市在长春正式营业，接下来将在沈阳、哈尔滨等地陆续开店，中国东北将成为京东X无人超市新店密集的区域。
京东自营的创建时间：1998年6月18日，刘强东先生在中关村创业，成立京东自营。
3、两者的基本功能不同：
京东超市的基本功能：京东超市最大的亮点是，顾客进店先“刷脸”，初次进入无人超市购物时，扫描二维码绑定顾客身份和支付信息，一次绑定“保终身”，当顾客再次光顾时，只需“刷脸”即可进店购物。
京东自营的基本功能：京东自营先后组建了上海及广州全资子公司，将华北、华东和华南三点连成一线，使全国大部分地区都覆盖在京东商城的物流配送网络之下；同时不断加强和充实公司的技术实力，改进并完善售后服务、物流配送及市场推广等各方面的软、硬件设施和服务条件。