1、行政区域不同：荆门和荆州同为湖北省地级市，辖区不同。
2、地理位置不同：荆门位于湖北省中部，荆州市位于湖北省中南部。
3、历史文化不同：荆门在夏商时属荆州之域，西周分属权国、鄀国，春秋战国属楚，汉置当阳县，唐立荆门县，宋建荆门军，元设荆门府，明复荆门县，清为荆门直隶州，民国降州为县，新中国成立后续为荆门县。1979年，分设荆门县、荆门市。1983年，荆门县与荆门市合并升为地级荆门市。
4、荆州是一座古老文化与现代文明交相辉映的滨江城市。“禹划九州，始有荆州。”荆州建城历史长达3000多年。自公元前689年楚国建都纪南城，先后有6个朝代、34位帝王在此建都。
5、从“天下第一循吏”孙叔敖到明朝万历首辅张居正，从荆州走出去的宰相达138位。从爱国主义诗人屈原到李白、杜甫，大批文人墨客在荆州吟诗作赋。
6、荆州是春秋战国时楚国都城所在地，是国务院公布的全国首批24座国家历史文化名城之一、中国优秀旅游城市、国家园林城市、重要的公路交通枢纽和长江港口城市。