1、冷藏：将龙眼4-6摄氏度的环境下冷藏保存，在这个温度下，龙眼有生命可以呼吸，却消耗很少的能量。新鲜果皮较软，不可堆太多层，保存至冰箱前最好将果皮风干，然后装在保温盒中，或者用保鲜膜、保鲜袋封存，再放到冰箱里。
2、纸盒保存：首先将新鲜的龙眼风干表皮，放在能透气的纸盒中，然后储藏在通风、阴凉并且比较干燥的地方即可。如果桂圆太多，可以用纸板加强承压度，将桂圆分层隔开放置，如果空间较多，可以将桂圆直接平铺放置，能避免桂圆的相互挤压。
3、速冻保存：在1小时内把龙眼果实的温度降到零下30摄氏度，并长期贮于零下18摄氏度的环境中，这样，果实能保持原来外观和固有风味，营养成分损失少。
4、也可以选择把新鲜的桂圆晒干后保存，晒干的桂圆保存的时间比较长。如果是晒干的桂圆，应放在箱子里，用塑料盖起来，然后放在阴凉处，要经常查看，预防发霉、虫蛀等。