1、冬虫夏草保存前也应彻底晾晒，保证干燥；如果发现虫草已经受潮，应立即取出暴晒，或用炭火微微烘焙，再筛去害虫与蛀屑。
2、保存的时候，如果量很少，而且储藏时间不长，只需将其与花椒或牡丹皮一起放在密闭的玻璃瓶中，置于冰箱中冷藏即可；如果量大或者需要存放较长时间，最好在储藏虫草的地方加放一些干燥剂。但是，总的来说，虫草的保存时间不宜过久，否则会降低药效。最好是购买少量，放入冰箱方便日常食用。
3、冬虫夏草之所以价格昂贵，是因为目前人工培植技术还不成熟，绝大部分还是依靠野生采挖，属于珍稀的天然资源。因其良好的滋补功效，冬虫夏草又常常被当作名贵礼品用于馈赠，但受赠人往往不懂得怎么保存，随手一放，没有使用特别的方法保存，使得冬虫夏草的保质期缩短，还有的人舍不得食用，把之保藏起来，甚至最后变质后只能扔掉，造成令人心疼的浪费。