重庆医科大学附属第二医院
重庆市中医院肛肠科始建于建国伊始。经过几代人不断发展，现今的肛肠科集医疗、教学、科研与预防保健为一体，中医特色优势显著。作为巴渝肛肠流派的主要传承者和代表者，在国内具有明显的学科优势。科室现为国家中医药管理局“十二五”重点专科、重庆市中医重点学科、重庆市中医重点专科，建立了名中医工作室、重庆市中医院中西医结合盆底中心、肠镜室等。科室以中西医结合治疗痔、肛瘘、肛周脓肿等肛肠科常见病经验丰富，优势突出；“枯切”治痔、“挂线”治瘘以及“四面二次固脱”治疗脱肛等特色疗法早在上世纪中叶就疗效卓著。
重庆市人民医院
重庆市第五人民医院普通外科是医院最早成立的学科之一，是南岸区重点学科、南岸区普外微创诊治中心、重庆市肛肠特色专科、重庆市区域性重点学科、重庆市临床重点专科。科室主要开展胃肠、肛肠、腹外疝和血管等专业。普通外科团队对本学科各专业组的常见病及多发病的诊断及常规手术积累了丰富的临床经验，熟练开展普通外科各专业组的3、4级手术。目前微创手术是科室的特色之一，常规开展腹腔镜胃癌、结直肠癌根治术和一些高难度高风险手术。普通外科目前分胃肠外科、肛肠外科、腹部疝血管外科三个专业组。
重庆市北碚区中医院
重庆市北碚区中医院肛肠科系重庆市中医重点专科，科室以“传承中医特色优势，以西医先进技术丰富诊疗层次，做好中西医结合，更好地服务大众”为基本理念。以中西医结合方式治疗痔、肛瘘、肛裂、肛周脓肿等肛肠科常见病种经验丰富，优势突出。科室能够开展肛周脓肿与肛瘘开窗药线引流术方法、注射法治疗痔疮，各类痔疮的微创（RPH自动痔疮套扎术、PPH吻合器痔上粘膜环切除手术、TST选择性痔上黏膜切除术）等手术。
重庆市南川区人民医院
重庆市南川区人民医院胃肠外科是以治疗胃肠、阑尾、疝、腹壁、肛肠和体表肿瘤疾病的专科。收治病种：胃肠道肿瘤；腹壁疝外科疾病；急腹症；肛周疾病；体表肿瘤。开展手术腹腔镜下胃癌根治术、腹腔镜下结直肠癌根治术、腹腔镜下腹股沟疝全腹膜外无张力修补术、腹腔镜直肠悬吊术、单孔腹腔镜下阑尾切除术、腹腔镜下小儿疝修补术、腹腔镜下成人疝修补术、腹腔镜下胃肠穿孔修补术、痔疮自动套扎术（RPH）、选择性痔上粘膜切除术（TST）、吻合器痔上黏膜环切术（PPH）等。科室针对腹部外伤病建立了完善的筛查评定及急诊绿色通道。