重庆市人民医院三甲医院
重庆市人民医院耳鼻咽喉头颈外科是1929年建院初期的主要科室之一，是重庆市较早设立耳鼻咽喉科门诊单位。2003年由市卫生局批准成立重庆市眼耳鼻咽喉科医院，成为重庆市一家三级甲等公立耳鼻喉专科医院，设置有耳、鼻、咽喉、头颈等各亚专科。2011年成为重庆市医学重点学科。2018年获批国家级鼻内镜培训中心和咽喉内镜培训中心，2019年获批国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心核心合作单位，2020年获批重庆市耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心。2022年获批重庆市临床精品专科、重庆市中青年医学卓越团队、重庆市首席专家工作室领衔单位、重庆市残疾儿童康复救助人工耳蜗植入手术定点医院。
重庆市肿瘤医院三甲医院
重庆大学附属肿瘤医院头颈肿瘤中心成立于20世纪90年代初期，是重庆市较早成立的集颈部外科、耳鼻咽喉科及口腔颌面外科于一体的头颈肿瘤临床专科，被重庆市卫计委评为重庆市唯一一所头颈肿瘤特色专科。科室是国家级耳鼻咽喉医师规范化培训基地、广西医科大学研究生培养基地、重庆市头颈肿瘤质控中心、重庆市头颈肿瘤GCP临床试验基地。重庆市医药生物技术协会头颈肿瘤专业委员会牵头单位。科室分为耳鼻咽喉肿瘤诊疗中心、口腔颌面诊疗中心、甲状腺肿瘤诊疗中心、头颈肿瘤整形修复中心四个亚中心。
重庆医科大学附属永川医院三甲医院
重庆医科大学附属永川医院耳鼻咽喉-头颈外科是集医疗、教学、科研为一体的专业外科，是医院重点建设学科，患者遍及渝、川、滇、贵等省市。科室率先在重庆市开展舌及口底再造术、前鼻孔缩小术、鼻内窥镜下小儿增殖体刨削术、颈动脉体瘤切除术、各类头颈颌面部因手术、外伤后器官组织缺损的修复及功能重建术。经数十年的发展，科室逐渐形成以头颈肿瘤诊疗、听力检测与康复、耳显微外科手术、过敏性鼻炎诊疗、睡眠呼吸障碍（鼾症）监测与手术、小儿耳鼻咽喉疾病诊疗、CO2激光显微手术为特色的专业外科。
重庆医科大学附属第一医院三甲医院
重庆医科大学附属第一医院耳鼻咽喉科是西南地区较早成立的诊治耳鼻咽喉科疾病的特色专科之一，1956年由上海医学院（现复旦大学医学院）眼耳鼻咽喉科医院分迁至重庆创立。科室现为博士和硕士学位授权点，是国家临床重点专科、重庆市耳鼻咽喉科临床质量控制中心、重庆市睡眠呼吸疾病诊治中心、国家临床药理基地、国家助听器验配师培训机构、国家贫困聋儿人工耳蜗抢救性康复项目定点手术医院。科室有设施完善的抢救室、听力检测室、助听器验配中心、电子喉镜室、鼻内镜室、耳显微镜室、重庆市睡眠呼吸疾病诊治中心、变态反应实验室等。
重庆医科大学附属第二医院三甲医院
重庆医科大学附属第二医院耳鼻咽喉科始建于1946年，由全国著名耳鼻咽喉科专家、英国皇家医学会会员吕钟灵教授担任首届主任，是西南地区较早的耳鼻咽喉专科之一，现为重庆市集医、教、研一体的重点学科。科室是全国中西医结合耳鼻咽喉头颈外科副主任委员单位、全国艺术医学协会嗓音专委会副主任委员单位、泛亚洲太平洋地区头颈部整形外科中国区副主席单位、中国中药协会耳鼻咽喉药物研究专委会副主任委员单位、全国耳鼻咽喉科眩晕疾病专委会副主任委员单位、重庆市重点学科、博士学位授予点、硕士学位授予点。
重庆市急救医疗中心三甲医院
重庆市急救医疗中心耳鼻咽喉科成立于1951年，经过数十年不懈努力，科室现已建成集临床、科研、教学于一身的专业学科。科室在耳鼻咽喉科危急重症和创伤救治方面具有较高水平，现开设项目有：耳鼻咽喉头颈创伤专科、头颈（肿瘤）外科、睡眠呼吸障碍专科（鼾症）、鼻-鼻窦炎专科、耳鸣及听力障碍专科、咽喉食道疾病专科。专业治疗耳、鼻、咽、喉、颌面等部位创伤缺损修复、功能重建及骨折整复、各种鼻炎、鼻窦炎的手术、非手术治疗、鼻腔及鼻窦肿瘤、鼻咽癌、喉癌、慢性咽喉炎、食管反流性咽喉炎、急性上呼吸道梗阻等。
重庆大学附属三峡医院三甲医院
重庆大学附属三峡医院1946年建立五官科，2003年成立耳鼻咽喉科，是渝东北地区规模大、实力强、较早独立的耳鼻咽喉科专科，经过几代人不懈的努力，本专业在医、教、研得到全面发展，现已成为渝东北片区耳鼻咽喉-头颈疾病的区域诊疗中心，重庆市知名的耳鼻咽喉专科之一。2018年成为北京同仁医院全国耳鼻咽喉联盟单位、重庆耳鼻咽喉头颈外科跨区域专科联盟副理事长单位、重庆市过敏性疾病免疫治疗质量控制协作组单位。2019年成为国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心网络成员单位。耳鼻咽喉科于2012年8月成为重庆市耳鼻咽喉专业住培基地，2017年10成为全国住院医师规范化耳鼻咽喉专业培训基地。