1、栖霞古寺
栖霞寺又称栖霞古寺，始建于南齐永明二年（484年），是中国四大名刹之一，佛教“三论宗”的祖庭，在中国佛教史上具有重要地位，南朝时期与鸡鸣寺、定山寺齐名，是南北朝时期中国的佛教中心。栖霞寺占地面积40多亩，共有毗卢殿、藏经楼三进院勤务，依山势层层上升，格局严整美观。栖霞寺前是一片开阔的绿色草坪，有波平如镜的明镜湖和形如弯月的白莲池，四周是葱郁的树木花草，远处是蜿蜒起伏的山峰，空气清新，景色幽静秀丽。
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江苏省南京市栖霞区栖霞街88号2、鸡鸣寺
鸡鸣寺又称古鸡鸣寺，始建于西晋永康元年（300年），是南京最古老的梵刹和皇家寺庙之一，香火一直旺盛不衰，自古有“南朝第一寺”，“南朝四百八十寺”之首的美誉，南朝时期与栖霞寺、定山寺齐名，是南朝时期中国的佛教中心。鸡鸣寺内现有大雄宝殿、观音楼、韦驮殿、志公墓、藏经楼、念佛堂、药师佛塔、胭脂井、豁蒙楼、景阳楼等主要建筑。大雄宝殿内奉祀三宝佛，外山门、三大士阁、钟鼓楼、禅房、素菜馆等建筑占地面积约5万平方米。
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江苏省南京市玄武区鸡鸣寺路1号3、灵谷寺
灵谷寺始建于南梁天监十三年（514年），是南朝梁武帝为纪念著名僧人宝志禅师而兴建的“开善精舍”，初名开善寺。明朝时朱元璋亲自赐名“灵谷禅寺”，并封其为“天下第一禅林”，为明代佛教三大寺院之一。灵谷寺内有放生池、金刚殿、天王殿、无量殿（又称无梁殿）、五方殿、毗卢殿、观音阁等殿堂，寺后有宝公塔。灵谷寺玄奘纪念堂中供奉玄奘法师坐像，像前的玄奘法师顶骨纪念塔中有玄奘顶骨舍利。
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江苏省南京市玄武区灵谷寺路2号4、大报恩寺
大报恩寺是中国历史悠久的佛教寺庙、中国的佛教中心。大报恩寺是明成祖朱棣为纪念明太祖朱元璋和马皇后而建，施工极其考究，完全按照皇宫的标准来营建，金碧辉煌，昼夜通明，整个寺院规模极其宏大，有殿阁30多座、僧院148间、廊房118间、经房38间，是中国历史上规模大、规格高的寺院。2013年，大报恩寺被国务院核定公布为全国重点文物保护单位。
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江苏省南京市秦淮区雨花路1号5、宏觉寺
宏觉寺始建于南朝503年，它背靠牛首山，对面是云台山，山南麓是目前江南地区最大的地下宫殿——南唐二陵，即南唐先主李弁的钦陵和他儿子李锦的顺陵。在明代正统年间，它是明代南京的八大国寺之一。清乾隆皇帝曾六下江南巡游，亲自为宏觉寺题“万法皆如”匾额。宏觉寺塔位于牛首山峰的东南坡，始建于唐大历九年（774年），现塔身是明初重建，宏觉寺塔是南京现存最雄伟的砖制仿木结构楼阁式古塔。1956年，塔底发现地宫，地宫藏有文物，以及鎏金喇嘛塔。
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江苏省南京市江宁区东善桥镇祖堂山6、毗卢寺
毗卢寺始建于1522—1566年，因庙中供养毗卢遮那佛，初名毗卢庵，金陵名刹之一，民国时期成为全国佛教的中心，中国佛教会、中华佛学研究会、中国宗教联谊会、首都中医院皆设于此。毗卢寺乃“金光明道场”，秉金光明精神，庄严国土，弘宣圣教，于金陵佛都独具特色。毗卢寺曾成立中国中医院，成为中国佛教研究和中医学研究的中心，对中国佛、医及文化有着不可估量的影响，是中国佛教从传统走向现代的标志性道场。
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江苏省南京市玄武区汉府街4号7、定林寺
南京方山定林寺是南朝佛教禅宗圣地、金陵名刹、“金陵四十八景”之一。历史上，定林寺分为“上定林寺”、“下定林寺”两处，位于方山的定林寺为下定林寺。南朝梁武帝萧衍时，来自天竺的达摩祖师留在国都建康（南京）期间，曾到下定林寺举行佛事活动，方山至今尚保留有“达摩崖”等历史古迹，为禅宗之祖达摩偃坐之地，故此，在佛教界有“南定林、北少林”之说。到了明、清时期，下定林寺香火很旺，随着庙舍不断增建，规模越来越宏大。
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江苏省南京市江宁区江宁科学园方山8、龙泉禅寺
龙泉寺始建于唐代，由唐代高僧鹤林素禅师募捐而建。目前主要景点有龙泉禅寺、断臂崖、观音洞、龙泉、地藏殿等。断臂崖高6米，宽约12米，进深4米，前宽后窄，上尖下敞，形似一座佛龛。相传，南宋岳飞大战金兀术于牛首山，岳飞部下一员战将的胳膊被金兵砍断，便躲进这崖洞里养伤，后被当地百姓发现。为纪念这位抗金将领，当地百姓称这里“断臂崖”，称这座山为“断臂山”。观音洞洞高1.13米，宽0.81米，并供奉一尊石刻观音像。
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江苏省南京市雨花台区铁心桥街道龙泉寺9、鹫峰寺
鹫峰禅寺始建于梁武天监年间，原名法光禅寺，后重建于明代天顺年，为纪念唐朝名僧鹫峰而得名。明清时期，鹫峰禅寺为金陵一大景观，古典小说《儒林外史》中就有“到鹫峰禅寺吃茶”的故事。书法家王铎、文学家焦竑在此留下诗文、墨迹。古寺历尽沧桑，至“文革”，这里只剩下破屋数橼，佛像全无。跨进新世纪以来，政府进一步落实宗教政策，将鹫峰禅寺归还佛教界。现已重建好大雄宝殿、毗卢殿、观音殿、地藏殿、钟楼、鼓楼、三门等，恢复了它庄严肃穆的清净之地的气质。
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江苏省南京市秦淮区白鹭洲公园内10、惠济寺
惠济寺又称古惠济寺，始建于南朝，初名汤泉禅院。南朝刘宋时，武帝刘裕万乘来游，南朝萧梁时，昭明太子萧统曾在此读书。清咸丰年间毁于战火，光绪年间复建其中部分，规模远不及以前。寺内三棵稀世之宝的古银杏树迄今皆已有1500多年的树龄，已列入“中国古典园林之景”，为江苏省文物保护单位。南朝萧梁昭明太子萧统曾在此修学，并亲手种下，名曰“千年垂乳”、“撑天覆地”、“雷击复苏”，至今仍枝繁叶茂传粉挂果，且所结白果无苦心，被誉为“佛缘圣果”。